离子色谱仪在环境监测中应用最早的是降水监测，因为利用离子色谱仪进行监测，能够减少监测时间，增加其监测的精确度，且其监测实验操作简单快捷。离子色谱仪应用于水和废水、空气和废气中相关污染物的监测也凸显了它的优势。
        在文献上看到了利用离子色谱仪测定空气中的氯化氢方法：
      第一，先采样环境空气样品，串联 2 支各装 10ml 吸收液的大型气泡吸收管，以 1L/min流量，采集 60min ；第二，将 2 支吸收管中的样品分别移入 10ml具塞比色管中，用少量淋洗液洗涤吸收管内壁，淋洗液一并移入比色管，稀释至于标线，摇匀。
      其次，将试样用 0.45μm 的乙酸纤维微孔滤膜过滤得到滤料，保持到离子色谱仪在大气环境监测中的应用四氟乙烯或聚乙烯塑料瓶中。做好这些准备工作，就可以应用离子色谱仪对其进行监测，监测过程中离子色谱只需要用少量的淋洗液以及再生液即可，无需过多的试剂，监测操作十分简单，并且监测实验用量少，可以减少因实验对造成的环境污染。
      传统的分析方法是硫氰酸汞分光光度法（HJ/T27-1999），当采样体积为 10L 时，最低检出浓度达 0.9mg/m³，当采样体积为 60L 时，最低检出浓度达 0.05mg/m³，使用离子色谱仪，当采样体积为 10L 时，离子色谱仪的方法最低检出浓度达 0.5mg/m³，当采样体积为 60L 时，离子色谱仪的方法最低检出浓度达0.003mg/m³。

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